Специалисты установили, что в её водах представлены соединения меди, цинка, марганца, нефтепродуктов, аммонийного азота. Ближе к устью содержание продуктов нефти превышено в 10 раз.
В 2017 году Обь потеряла питьевое значение из-за построенных предприятий в городах по её течению. Не все из них установили качественное очистное оборудование.